آلیس باردار متوجه می‌شود که فردی کروگر از طریق ذهن خواب‌زده فرزند متولد نشده‌اش حمله می‌کند، به این امید که دوباره در دنیای واقعی متولد شود.

با الهام از لحن کمدی فیلم‌های «دانشکده پلیس»، آکادمی نینجا مجموعه‌ای از شخصیت‌های خنده‌دار را به تصویر می‌کشد که در حین تمرینات سخت، تفریح و در نهایت شکست‌های سخت در دنیای بی‌رحم هنرهای رزمی، پیوند نزدیکی با یکدیگر برقرار می‌کنند.

دو دزد در غیاب صاحب‌خانه، از یک خانه بزرگ و مجلل سرقت می‌کنند. اما وقتی یک بازدیدکننده آن‌ها را با صاحب‌خانه اشتباه می‌گیرد و آن‌ها متوجه می‌شوند که یک مهمانی انتخاب بازیگر برای آن روز برنامه‌ریزی شده است، تصمیم می‌گیرند برای خوش‌گذرانی همان‌جا بمانند. تنها یک مشکل کوچک وجود دارد، یک اشتباه فنی در نقشه‌شان: صاحبان واقعی خانه پول زیادی به چند آدم خطرناک بدهکارند و آن‌ها برای نقد کردن طلبشان سر می‌رسند.